Essa sorge sui resti di una antica chiesa medievale ed è situata nel centro storico. Essa ha tre navate, ha avuto diversi rifacimenti e ha uno stile barocco romano. Nel periodo natalizio, all’interno vi si addobba un ammirevole presepe.

La religiosità della comunità di Villa Santo Stefano è nelle cose. Basta contare quante chiese e santuari ci sono nel piccolo centro storico e nel resto del suo territorio, fin sopra la montagna, quante processioni si fanno nel corso dell’anno e quante sagre vengono dedicate ai Santi a cui i cittadini sono devoti.
La Madonna dello Spirito, nell’omonimo santuario, è dispensatrice di miracoli e una lunga lista di cittadini è pronta a testimoniare le grazie ricevute.
San Rocco, raffigurato in una statuetta lignea conservata nella chiesa di San Sebastiano, viene portato in processione per il paese la sera tra il 15 e il 16 di agosto e poi si fa festa con la «panarda»: una  zuppa di ceci cucinata in calderoni di rame stagnato (callare).
Tra le numerose strutture religiose, alcune sono di epoca remota e sono ancora da recuperare, di altre si conserva solo immagini e documentazione perché sono state abbattute per trovare spazi sociali. Ne restano però sempre molte, alcune anche di recente recupero, ma certamente tutte hanno una propria caratteristica e sono molto amate. I patroni e i santi che i cittadini pregano sono portati in processione e danno vita a sagre, feste e manifestazioni a cui lavorano i cittadini e che sono un’occasione importante per rafforzare l’identità della popolazione e ospitare turisti sensibili e attenti ai valori religiosi e alle tradizioni culinarie. Ne descriviamo alcune, ma lasciamo al turista il gusto della loro scoperta.

La chiesa è accessibile liberamente dalla popolazione attraverso l'entrata principale.